国家公园和生物多样性
各种保护区的面积约占全国面积的 25%。巴拿马有 13 个国家公园，其中包括一个国际公园。
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奥马尔-托里霍斯国家公园（25 275 公顷）：位于巴拿马的中科迪勒拉山系，从高处俯瞰，大西洋和太平洋的美景尽收眼底。1981 年，托里霍斯将军的飞机就是在科克莱省的这个公园里坠毁的，坠毁在海拔 1046 米的玛尔塔山（Cerro Marta）的山坡上，离白玫瑰山（Cerro Peña Blanca，海拔 1314 米）不远。徒步旅行者可以沿着公园的三条标志性小径前行：Los Helechos、La Rana 和 Cuerpo de Paz。
萨里瓜国家公园 （4729 公顷）：该公园位于埃雷拉省，保护着 "萨里瓜沙漠 "这一生物多样性丰富的干旱盐碱地。其独特的生态系统包括红树林和鹈鹕。
巴鲁火山国家公园（14322 公顷）：该公园位于奇里基省，是同名火山生态系统的所在地，也是巴拿马的最高点，海拔近 3500 米，位于塔拉曼卡山脉。除了目前处于休眠状态、可以攀登（格查尔小径）的火山外，公园内还有众多河流灌溉，动植物种类繁多。
拉阿米斯塔德国际公园（20.7 万公顷）：巴拿马和哥斯达黎加共同拥有的联合国教科文组织世界遗产，是 "中美洲生物走廊"。这里的热带雨林（或称迷雾森林）被认为包含了中美洲五分之一的物种。
巴斯蒂门托斯岛国家海洋公园 （13226 公顷，包括 1630 公顷的岛屿陆地）：该海洋公园位于博卡斯德尔托罗群岛，保护脆弱的环境，包括红树林、珊瑚礁和海龟产卵的海滩。
达连国家公园 （57.9 万公顷）。这片广袤的土地既是生物圈保护区，也是联合国教科文组织世界遗产，其特点是生物多样性和生态系统的多样性：平原、湿地、山脉。这里的海滩、红树林和热带森林尤其值得一提。这里记录了超过 56 种受威胁或濒危物种、众多特有物种和 450 种鸟类。不过，应该指出的是，达连丛林是一个远离公路的危险地区，武装帮派在这里猖獗，有时会以从南美过境到北美的移民为代价。
巴拿马运河和中美洲走廊的环境影响
巴拿马运河是物种流动的 "自然 "路线，使生物体的进化动态得以维持。然而，巴拿马运河的建设造成了自3100万年前巴拿马地峡形成以来从未出现过的物理断裂。为了恢复生态的连续性，1998年启动了一个中美洲走廊项目。它的目的是连接高度自然保护区，允许物种迁移，恢复生态系统，从而保持生物多样性。
，运河也对运河的湖泊产生了影响，而海上交通导致空气和水的质量恶化，以及入侵物种的蔓延。
保护生命的捍卫者和大自然的权利
自2018年以来，该国一直是《埃斯卡苏协议》的签署国，该协议旨在保护自然活动家和捍卫者。该协议在拉丁美洲和加勒比地区的多个国家实施，旨在保障原住民的权利。
，该国还在努力使自然成为法律的主体。2023年生效的一项法律赋予大自然 "存在、持续和再生其周期的权利"，使其代表（法律实体或个人）能够在法庭上捍卫它。
走向农业生态学实践
森林砍伐也是该国的一个主要问题。农业生态学和农林项目正在全国各地展开。其中一个例子是木麻黄试验，它涉及到植树和放牧的结合。这种方法有很多优点：它通过保持自然栖息地来促进生物多样性，为农民提供收入，并有助于储存碳。
面对气候变化
巴拿马特别容易受到气候变化的影响，这体现在极端事件的频率和强度增加。例如，2022年10月，朱莉娅飓风重创了该国。它还遭受了长期和严重的干旱，在2019年导致加通湖和阿拉胡埃拉湖的水位下降，这些湖泊为巴拿马运河提供水源（对海上交通产生影响），并有助于饮用水和水电的供应。另一个有力的象征是，圣布拉斯群岛受到海平面上升的威胁，导致人们迁往大陆。
该国已开始实施一项国家能源计划（2015-2050），特别是旨在增加可再生能源的份额，目标是到2050年达到50%。
围绕一个铜矿的动荡和谈判
巴拿马有一个巨大的露天铜矿，占其国内生产总值的4%，由一家加拿大公司First Quantum Minerals特许经营。2023年3月，经过几个月对该矿区特许权续期条件（经济条款，包括特许权使用费金额，以及环境和社会承诺）的争议，巴拿马和运营公司达成了协议。将采取哪些措施来尊重环境、工人和当地居民，还有待观察。铜矿是世界上消费最广泛的金属之一，今天具有巨大的经济和战略利益，但同时也对环境和社会产生了重大影响（特别是水和空气污染、森林砍伐、土地退化、自然栖息地的消失、有害废物的产生）。待续。
大坝是冲突的根源
2017年在奇里基省投入使用的巴罗布兰科大坝的建设，引起了保卫塔巴萨拉河的恩加贝原住民与巴拿马政府之间的冲突，导致工程在2015年一度暂停。建造这样一个设施时，该国的能源部门正在进行私有化，导致能源生产与该国的需求脱节，并且没有真正考虑到环境和当地居民。
