三个热区
萨尔瓦多的年平均气温为 31°C，年平均降雨量为 739 毫米。全年无降雨的天数为 176 天，平均湿度为 73%，紫外线指数为 6。
萨尔瓦多根据海拔高度分为三个温度带
0 至 800 米： 平均气温随海拔升高而降低，沿海平原从 27°C 降至 22°C，内陆平原从 28°C 降至 22°C。
800 米至 1 200 米： 平均气温随海拔升高而降低，高原地区从 22°C 降至 20°C，山麓地区从 21°C 降至 19°C。
海拔1,200 米至 2,700 米： 高原和山谷地区平均气温为 20°C 至 16°C，山麓地区平均气温为 21°C 至 19°C，海拔 1,800 米以上地区平均气温为 16°C 至 10°C。
内陆地区有火山、高原和山脉，气候随海拔升高而变冷。在中等海拔地区，有云雾林。在海拔 2000 米以上的高海拔地区，冬夜会很寒冷。最高点是 Cerro El Pital（海拔 2730 米）：从 11 月到次年 3 月，在山顶附近可以看到积雪。
首都圣萨尔瓦多海拔 700 米，仍处于炎热地带，但海拔高度使炎热变得更容易忍受，全年最高气温从 9 月至 11 月的 30°C 到 3 月和 4 月的 32.5°C，雨季来临前的这两个月更加炎热。全年最热的日子是 3 月至 5 月，气温可达 35°C 至 36°C。11 月至次年 3 月的最低气温略低于 20°C。5 月至 10 月的雨季依然闷热。
太平洋沿岸的天气更加炎热，夜间气温在 23 摄氏度和 25 摄氏度之间波动，最高气温在 32 摄氏度和 33 摄氏度之间。特别是在雨季到来之前的 3 月和 4 月，有时会出现非常炎热的天气，气温可达 37°C 至 38°C。
十月风
每年十月，当雨季结束时，会出现一系列非常著名的风，萨尔瓦多人称之为 "十月风"，孩子们则称之为"encumbran piscucha"（放风筝）。这种现象与萨尔瓦多的地理位置有关。它位于热带带的北部，因此在 11 月和 10 月，主要受东北风和偶尔出现的阵阵北风的影响，这些风带来了来自北美极地的冷空气，但当这些冷空气穿过墨西哥湾吹向中美洲时，气温会明显升高。
