国家公园和生物多样性保护
马约特岛海洋公园创建于 2010 年，是一个包括完整保护区在内的广阔保护区。这里是儒艮、玳瑁和白蟹等濒危物种的家园。公园的使命是通过规范人类活动（包括捕鱼）、支持恢复自然环境的措施、支持可持续发展的产业以及促进海洋生态系统研究来保护这些生态系统。
防止污染
该地区的湿地（河流、红树林、泻湖）受到严重污染。海洋公园观察站的数据显示，每 100 米海滩上有 8 公斤废物，主要是塑料。海滩上海龟的尸体显示，海龟的死亡与摄入废物有关。废物管理方面的缺陷造成了这种情况。废水收集和处理也不足。针对这种情况，一些协会正在采取行动，通过收集垃圾来提高岛上居民和游客的意识。例如，一个协会在全岛发起了 "清洁徒步旅行"，将生态公民意识与体育活动相结合。
恢复自然环境
自然环境也因土地使用的变化而受到影响。城市化和农业用地的扩大，再加上某些做法（刀耕火种），正在造成自然栖息地的破坏和生物多样性的丧失。砍伐森林是该地区某些地方的一个问题，据说那里的红树林减少了 25%。这些生态系统是生物多样性的宝库，有助于保护海岸免受气候灾害的影响。为此，在红树林沼泽地和被称为 "padzas "的毁林地区发起了补种倡议。
水的关键问题
马约特岛的水资源有限。其饮用水供应 80% 依靠两个山丘水库。自 2017 年以来，该岛一直严重缺水，导致定期配给和断水。在岛上的一些地方，每周持续两到三天的缺水已不再罕见。为防止这种情况发生，酒店正在采取措施，安装地下储水箱，以便在配水日储存水。但并不是每个人都有能力这样做，有时会用一个简单的浴缸和一个水瓶作为备用水箱，供客人使用。这种必要的管理方式加剧了某些社会矛盾，并导致灾难性的局面，例如霍乱卷土重来，在 2024 年造成数人死亡。
面对气候变化
马约特特别容易受到气候变化的影响。这可能导致极端现象（干旱、洪水）发生的频率和强度增加。它尤其受到海平面上升的威胁。此外，还有沉降现象，这与一座水下火山的形成有关，这座火山深达 3500 公里，但距离马约特岛只有 50 公里。某些水域的停滞也会助长病媒传播疾病的发展，因为它助长了滋生地的存在。
