森林
它们覆盖了55%到60%的领土（28,000-30,000平方公里）。它们主要分布在山区和半山区，其中70%是国有的。三种最具象征性的树木是雄伟的波斯尼亚松（Pinus heldreichii），它生长在巴尔干地区海拔2500米的地方；特有的塞尔维亚云杉（Picea omorika），它只在这里和塞尔维亚发现；以及波斯尼亚枫树（Acer obtusatum），斯特拉迪瓦里的小提琴就是用它制作的。然而，最常见的树种是巴尔干山毛榉（Fagus moesiaca）、毛栎和霍姆栎。森林以巴尔干山毛榉为主，800米以下为无柄栎、霍姆栎、银椴、山梨树和各种针叶树。接下来是针叶和落叶混交林（24%）：挪威云杉、白杉、苏格兰松、穆戈松、山毛榉、各种橡树和灰烬，以及主要分布在图兹拉地区的波斯尼亚枫树。其次是无柄橡树林（14%），它与角树、花白蜡和银灰一起出现在这里。最后一个主要类别是松树林（7%），在波斯尼亚中部以及与塞尔维亚和黑山的边境地区，松树林爬上了该国最高的山峰，海拔超过2300米。这里是波斯尼亚松、普通云杉和白杉的天下。但非常罕见的塞尔维亚云杉，其高度可以达到35米（与波斯尼亚松一样），只在两个地区发现：维舍格勒周围和德里纳河谷。其他类别包括湿地森林和地中海森林（橡树、松树、杜松、灌丛等），它们在南部地区占主导地位。该国还有五个小型原始森林，人类从未干预过：秘鲁奇卡（1434公顷，位于苏捷斯卡国家公园）、洛姆（298公顷，靠近博桑斯基-彼得罗瓦茨）、扬伊（295公顷，靠近希波沃）、普列希维卡（39公顷，靠近比哈奇）和茹查-里布尼卡（32公顷，靠近卡坎伊）。自2021年起，雅尼森林还被列入联合国教科文组织的欧洲原始森林世界遗产名录。总的来说，波斯尼亚的森林状况相当好，由于该国的荒漠化，森林的地位也在不断提高。林业部门占活跃人口的5%，占出口的15%。然而，一些橡树和松树森林被非法砍伐。
地方性物种
就地方性而言，巴尔干地区拥有欧洲最丰富的生物多样性，即原产于该地区和/或只在该地区发现的植物或动物物种。例如，在波斯尼亚-黑塞哥维那，有大约5000个物种，其中540个是地方性的，地方性率为10.8%。相比之下，面积大11倍的法国大都会的地方病率为6.3%（在51400个物种中，有3251个地方病物种）。 仅黑塞哥维那（占领土的20%）就有全国一半的地方病物种。这是由于其多样的地形和不同的气候造成的。例如，内雷特瓦盆地是该国十来种特有鱼类的家园（见下文）。Vjetrenica洞穴（靠近特雷比涅）是37种独特物种的家园，包括一种甲虫（Scotoplanetes arenstorffianus）和一种虾（Troglomysis vjetrenicensis）。它被列为联合国教科文组织世界遗产，是世界上第二大生物多样性的洞穴。在全国范围内，岩溶洞穴中充斥着特有的昆虫、软体动物、甲壳动物和蛛形纲动物。最令人惊讶的是最近发现的两种假蝎子（蜘蛛体和蝎子爪）：2017年在利夫诺附近发现的Neobisium radjai，以及2007年在特雷比涅附近发现的Roncus travuniensis。在花卉方面，已经记录了大约三十个地方性物种。一些铃铛花，如Campanula hofmannii，只生长在Cvrcka峡谷（Banja Luka附近）。黑塞哥维那高原上有一种紫色康乃馨（Dianthus freynii）、一种紫红色的咸菜（Acinos orontius）、一种开花的豆科植物（Oxytropis prenja）和Prenj山紫罗兰（Viola prenja）的家园。但该国最著名的花无疑是波斯尼亚百合（Lilium bosniacum）。它在中世纪是波斯尼亚国王的标志，现在是波斯尼亚社区的象征。
哺乳动物
波斯尼亚和黑塞哥维那最大的陆地哺乳动物是棕熊，雄性棕熊的体重可达700公斤。它的数量估计为1,000只。它是巴尔干半岛上仅次于罗马尼亚（6000只）的第二大动物。波斯尼亚植物人分布在北半部山区和丘陵的森林地区。但它们的数量正在减少（2011年至2021年期间为-200只）。这是由几个因素造成的：偷猎、车辆碰撞、地雷爆炸和合法狩猎。是的，这个国家仍然有许多上次战争留下的雷区，特别是在难以到达的森林里。是的，根据授予狩猎协会的配额，仍然允许猎熊。事实上，合法狩猎几乎适用于所有哺乳动物，包括熊和狼等濒危物种。狼的数量下降得更加惊人，从2006年的600只，到现在只剩下350只。它主要生活在靠近塞尔维亚和黑山的地区以及该国的中部地区，在Čemernica森林（Fojnica附近）、Vlašić山（Travnik附近）和Janj原始森林（Donji Vakuf附近）。另一个捕食者已经消失了：巴尔干猞猁（Lynx lynx balcanicus），它最后一次在波斯尼亚和黑塞哥维那出现是在1911年。在北马其顿和阿尔巴尼亚只剩下50只这种猫。但另一个典型的巴尔干物种正在蓬勃发展。这就是金豺（Canis aureus），2021年其当地人口约为2,000人，估计每年增长35%。狼的这个小表弟主要分布在北部的潘诺尼亚平原。其他捕食者包括狐狸、野猫、竹竿猫、黄鼠狼、獾、水獭和小印度獴（Urva auropunctata），后者于1910年被进口到克罗地亚群岛，现在是一个非常令人担忧的入侵物种。至于纽姆的小海岸线（20公里），有时会有鲸类动物来访，如里索氏海豚 （Grampus griseus）。
在食草动物中，最引人注目的是野猪、鹿、狍子和一个濒临灭绝（但被猎杀）的亚种：巴尔干麂（Rupicapra balcanica），它生活在苏捷斯卡国家公园和Blidinje（Tropolje）自然保护区内。在莫斯塔尔附近，特别是利夫诺（Tropolje），也有成群结队的马匹回到了野外。兔子和野兔与大约30种啮齿动物生活在一起，包括红松鼠、旱獭、海狸和Nannospalax leucodon，一种盲目的巴尔干鼹鼠。此外，还有29种蝙蝠。米沙里卡洞穴（靠近巴尼亚卢卡）被认为是巴尔干地区最大的蝙蝠 "母性 "洞穴之一，成千上万的大鼠和Schreibers'minipedes在夏季来到这里繁殖。
河鱼
世界各地的飞鱼爱好者都知道，波斯尼亚和黑塞哥维那的河流是欧洲最丰富的河流之一。它们是虹鳟鱼、褐鳟鱼、梭子鱼和各种鲤鱼的家园，尤其是世界上最大的鲑鱼之一：Hucho或多瑙河鲑鱼 （Hucho hucho），它可以达到1.50米长，重达50公斤。多瑙河流域的这种濒危物种使波斯尼亚-黑塞哥维那成为其最后的避难所之一。不幸的是，该国的河流正处于危险之中。与其说是由于实行 "不杀生 "的业余渔民，不如说是由于水力发电站的扩散。2020年，当400多座大大小小的新水坝被计划或已经开始建设时，面对当地居民的反对，当局颁布了一项暂停令。在拥有最多鱼类的六条河流中，首先是小Ribnik（靠近Banja Luka），那里主要有普通灰鱼和fario鳟鱼。萨尼卡河（Sanski Most附近）是一条美丽的山河，有大量的梭鱼、灰鱼和少量的胡琴鱼。这两条河都汇入萨纳河，那里有鳟鱼，同样也有少量的胡鲑。萨纳河的另一条支流乌纳河是该国最美丽的河流。它是虹鳟鱼、褐鳟鱼和huchon的家园。但最令人惊讶的是内雷特瓦河及其支流，它们有许多特有的物种。在鲑鱼类中，有齿状鳟鱼（Salmo dentex）、大理石鳟鱼（Salmo marmoratus）和内雷特瓦软唇鳟鱼（Salmo obtusirostris oxyrhinchus）。
鸟类
该国有321种鸟类，其中三分之二在当地筑巢。它们集中在三个地区，每个地区都有一个拉姆萨尔认可的湿地：黑塞哥维那和它的邻国Tropolje，以及沿萨瓦河的Bardača沼泽。在黑塞哥维那，Hutovo Blato自然保护区（74平方公里，拉姆萨尔）在任何时候都有多达10,000只鸟：侏儒鸬鹚、来自非洲的苍鹭、在水边高处筑巢的镰刀朱鹭（Plegadis falcinellus），以及大群的各种战斗机（Philomachus pugnax）。在鸭子中，请注意红结（Netta rufina），这在欧洲并不常见。在黑塞哥维那，莫斯塔尔也是观赏典型的巴尔干物种的好地方：黄嘴鸭（Pyrrhocorax graculus），它有雄伟的飞行，以及在内雷特瓦河中觅食的北斗七星（Cinclus cinclus）。附近的普雷尼山和波德维列日高原是罕见的岩鹑（Alectoris graeca）的家园，它们在海拔1000米以上的岩坡上筑巢。黑塞哥维那也是候鸟的家园，如色彩斑斓的紫貂（Cecropis daurica）、莺（Curruca crassirostris）、白腹飞燕 （Tachymarptis melba），它可以飞行数月不落地，以及绚丽的鵖（Upupa epops）。Tropolje地区有两个重要的自然遗址。利夫诺波列（Livno polje）的巨大岩溶平原（459平方公里，拉姆萨尔）是世界上最大的经常性洪水区域，也是候鸟最喜欢的停留地，如短趾鹰、白琵鹭和鸡冠花（Crex crex）。人们还可以遇到在西欧罕见的定居物种：白背啄木鸟（Dendrocopos leucotos），迪纳拉阿尔卑斯山的典型物种；小红雀（Carpodacus erythrinus），主要分布在亚洲；玫瑰胸鵙 （Lanius minor），最近在法国消失了；以及红嘴鸥（Aythya ferina），一种濒临灭绝的潜水鸭子。在特罗波尔耶和黑塞哥维那的边界上，布利丁耶自然保护区（358平方公里）是林地鸟类的家园，如卡佩卡利鸟和鹰鸮，它们在悬崖上筑巢。该保护区的湖泊还吸引了灰鹭和大黑背海鸥（Larus cachinnans）等越冬物种。在该国北部，巴尔达卡沼泽地（35平方公里，拉姆萨尔）有一些与Hutovo Blato和Livno polje相同的鸟类，但数量较少。在那里筑巢的有白鹳、小白鹭、小黄雀（鹭类中最小的一种）和一种海鸟--普通燕鸥。但除了白尾鹰（Haliaeetus albicilla）之外，曾经生活在这里的大型猛禽已经消失了。有些是在该国东部发现的，如狮鹫和金雕，在苏捷斯卡和德里纳国家公园里还有几对。
爬行类动物
在该国存在的14种蛇中，有三种对人类是危险的。角蝰蛇（Vipera ammodytes） ，是最危险的。它长约85厘米，生活在海拔2000米以下的岩石或沙地上，它的毒液比其他毒蛇的毒液强10倍。它可以导致死亡，最近在萨拉热窝周围已经报告了几起（非致命）事件。问题是，当地医院的抗蛇毒血清很快就会用完，这种情况已经发生过。奥西尼毒蛇（Vipera ursini）可长到50厘米长，它的咬伤可引起并发症（发烧、恶心......）。更为罕见的是波斯尼亚毒蛇 （Vipera berus bosniensis），这是一种长度为40厘米的巴尔干半岛小型物种。这三种毒蛇可以通过其黑色的人字形图案来识别。该国有22种两栖动物：12种青蛙和蟾蜍，10种蝾螈和蝾螈。其中，波斯尼亚高山蝾螈（Ichthyosaura alpestris reiseri）只在普罗科什科湖（Fojnica附近）发现。
蛛形纲动物
蛛形纲动物（蜘蛛和蝎子）这个群体继续增长，每年都有新的发现。现在全国大约有200种蜘蛛，其中大约30种只在这里发现，大部分是troglodytes。在森林和乡间，要小心Theridi科，它的腹部呈球状，其毒液可以杀死一只老鼠。这是2011年报告的波斯尼亚Theridion（Theridion bosniense）的情况，是一种地方性的蜘蛛。当地的蝎子不太危险，因为它们的毒液通常只对人类有轻微的皮肤影响。然而，如果你在乡下睡觉，记得晚上把鞋子反过来穿：这样可以避免你在早上穿鞋的时候出现讨厌的惊喜。目前有五种蝎子，都是巴尔干半岛的特有物种。
