热带气候
雨季一般从四月底开始，会有短暂的阵雨。到 6 月，每月降雨量超过 250 毫米。大多数时候，雨都是在傍晚或夜间下的。降雨有助于冷却大气，然后停止。
洪都拉斯的气候在太平洋和加勒比海沿岸属于热带气候，全年气温在 28 至 32 摄氏度之间。与北海岸相比，中部和南部地区相对温暖，湿度较低。
内陆山区的气候则较为温和。例如，首都特古西加尔巴位于内陆，1 月份平均气温为 25°C，4 月份平均气温为 30°C。
在加勒比海低地，只有在 12 月或 1 月，来自北方的强大冷锋有时会带来连续数天的强劲西北风和稍凉的气温，使人们从全年的炎热和潮湿中解脱出来。
温暖地带的低海拔地区属于热带气候，而温带地区的中等海拔地区则属于温带气候，山顶地区则较为凉爽。
该国位于北纬 13 至 16 度之间，北临加勒比海，南濒太平洋。中部为丘陵和山脉。
就降雨量而言，中南部 11 月至次年 4 月为旱季，5 月至 10 月为雨季，而北部则是无旱季区，因此可定义为赤道气候。
两坡的气候差异还体现在植被上：内陆地区和南坡以热带草原为主，而北坡则以热带森林为主。
这是因为冬季吹东北信风，即使在冬季也会给北坡降雨。
从 12 月到次年 3 月，偶尔会有来自美国的冷气团到达洪都拉斯。在这种情况下，特古西加尔巴的夜间气温会降到 10 度左右，平原地区则会降到 13/15 度左右。
各地区气候
对于游泳来说，洪都拉斯的海水 全年都相当温暖：加勒比海的水温在 27 摄氏度到 29 摄氏度之间，太平洋的水温略高。
北部的加勒比海沿岸直接受信风影响，多雨，年降雨量达 2,600/3,000 毫米。不过，虽然没有真正意义上的旱季，但在 2 月至 4 月期间，降雨量通常会减少，尤其是在 3 月和 4 月，这在东部地区（格拉西亚斯-阿迪奥斯省）更为明显，每月降雨量减少 50 至 60 毫米。西部的降雨量则不太明显：在特拉（Tela）和拉塞瓦（La Ceiba），降雨量达到每月 80/90 毫米。
罗阿坦岛和属于海湾群岛部的其他加勒比岛屿（瓜纳哈、乌提拉、卡约科奇诺斯）也全年气候温暖，但 11 月至次年 2 月为凉爽季节，5 月至 10 月为炎热酷暑季节，雨量充沛，没有真正的旱季。
罗阿坦岛的平均气温从一月的 25.5 摄氏度到八月和九月的 29 摄氏度不等。作为一个岛屿，这里的气温相当稳定，但从 12 月到 3 月，气温有时会低于 20°C，而从 4 月到 10 月，最热的时候气温可达 33/34°C。
洪都拉斯内陆由丘陵和山脉组成。在南部山坡和内陆地区，雨季从 5 月持续到 10 月，7 月和 8 月降雨量减少，因此最潮湿的月份是 5 月至 6 月和 9 月至 10 月。首都特古西加尔巴位于海拔 1000 米以上的所谓温带地区，气候比海平面地区更加宜人：白天气温一般在 12 月的 26.5 摄氏度到 4 月的 31 摄氏度之间。
从 12 月到 3 月，在最寒冷的夜晚，气温一般会降到 10°C 左右，但有时也会降得更低。科潘玛雅考古遗址位于海拔 700 米以上的地方，因此比首都稍暖和一些。海拔越高，气候越凉爽。在海拔 1700 米的拉埃斯佩兰萨，一月的平均气温为 15.8°C，五月为 19.3°C。
12 月至 3 月，最低气温可降至 5°C 甚至更低。
在最南部的 山谷省和乔卢特卡省，有一片地区可以俯瞰丰塞卡湾，然后濒临太平洋。海岸边有沼泽和红树林。海湾中有许多岛屿，包括大萨卡特岛（Isla Zacate Grande）和埃尔蒂格雷岛（El Tigre）（阿马帕拉镇所在地）。东北信风使得太平洋一侧的空气非常炎热干燥，尤其是在旱季，因为风从山上吹下来，温度会升高。事实上，在最热的月份（3 月和 4 月），南部平原的日平均气温甚至达到 31/32 度，而如上所述，北部的日平均气温不超过 27/28 度（5 月至 6 月是最热的时期）。12 月和 1 月的差异更大：南部沿海地区的气温约为 29/30 度，而加勒比海沿岸地区的气温为 23/24 度。
至于降雨量，这里和中部地区一样，5 月至 10 月是雨季，7 月降雨量相对减少。对于游泳来说，太平洋的海水也是全年温暖。
