哺乳动物
阿尔萨斯最著名的哺乳动物无疑是阿尔萨斯仓鼠，它曾经被称为 "斯特拉斯堡旱獭"。不幸的是，除了在Naturoparc，你几乎没有机会看到它。由于集约化的农业，它几乎已经消失了，但许多协会正在努力重新引入它。你肯定会有更多的机会看到鹿、狍子、野猪和狐狸在小路上。只要稍加努力，通过攀登一些山顶，你就能见到麂子，它们是被引进的，但现在已经很适应了。最后，最幸运的人可能会与两种谨慎和受保护的食肉动物--狼和猞猁擦肩而过。
爬行动物和两栖动物
在阿尔萨斯已经发现了四种爬行动物：普通吊带蛇（发现于阿尔萨斯平原和海拔800米以下）、光滑冠蛇（发现于孚日山麓和阿尔萨斯博苏地区）、蝰蛇（发现于里博维耶和鲁法赫地区的孚日山下的干燥草地）和蝰蛇（发现于拉普特罗埃地区的泥炭沼泽）。不要惊慌，蛇比你更害怕你！这是个好主意。阿尔萨斯有许多湿地，也是许多罕见的两栖动物的天堂，如斑点蝾螈，它激发了中世纪的纹章和传说。
鸟类
整个地区的鸟类非常多。芦苇荡是迁徙物种和卷尾鸥定居的首选休息地。在北孚日地区，你可能会看到鹰鸮、游隼、小鸮Tengmalm和Chevêchette或悬崖附近的大乌鸦。森林中生活着啄木鸟（包括最大的黑啄木鸟）、鸡冠花、小鸟和黄雀，一些山区是毛冠花的家园，人们听到的比看到的多。
当然，说到阿尔萨斯的鸟类，就不能不想到鹳鸟!在20世纪70年代，甚至没有50个这样的人。今天，由于众多的保护计划，鹳鸟随处可见，甚至在城市里也有！但这并不意味着它不存在。在春天，它们特有的喙叫声宣布婴儿即将到来，对它们来说是这样，对你来说也许也是这样。的确，在阿尔萨斯，孩子们不是从白菜或玫瑰中来的，而是由鹳鸟掉下来的！"。后者也有权力宣布婚姻。如果你是一个未婚女子，而他们中的一个人在地面上接近你，那么它很快就会到来了！这是很重要的。自然公园
阿尔萨斯有两个自然公园。他们的使命是通过对自然环境和景观的适当管理，长期保护遗产，同时促进经济、社会和文化发展。
横跨阿尔萨斯和洛林，北孚日山地区自然公园创建于1975年。它占地1300多平方公里，其中一半以上被森林覆盖。它的最高点是大温特斯堡，海拔581米。它有2600公里的步行、骑马、山地自行车和自行车路线，包括1700公里由沃斯吉恩俱乐部标记的道路。三十多座废墟城堡的存在也是这一地区的特点之一。
巴隆-德-孚日地区自然公园创建于1989年，几乎涵盖了山地的南半部，分布在四个省（上莱茵省、上索恩省、孚日省、贝尔福地区）：3000平方公里。几乎四分之三的领土被森林所占据。它有400个泥炭沼泽和4个自然保护区。它的最高点也是孚日地区的最高点：大巴隆，海拔1424米。巴隆公园的总部位于明斯特，提供定期更新的展览空间，以及有关上沃斯山地、动物、植物、住宿等方面的信息。自然保护区
莱茵河构成了阿尔萨斯和巴登-符腾堡州的天然边界。河边有五个自然保护区，提供了各种各样的栖息地。水臂、池塘和泥滩、湿草地和干草原、砾石坑和冲积林是各种丰富的动植物的家园。对各种鸟类、两栖动物和爬行动物、昆虫等，以及植物群和真菌的科学研究经常进行。
绍尔三角洲自然保护区由柳树林、泥滩、芦苇丛和莎草草场组成，保证了风景的变化。这片486公顷的土地从鸟类学和植物学的角度来看是非常了不起的，但从景观和水文的角度来看也是如此，因为它是莱茵河水在发生洪水时流经的最后地段之一。
奥芬道夫森林自然保护区位于前莱茵河砾石滩上，保护着60公顷的冲积森林。 在开阔地带，英国柳树、高大的紫罗兰、沼泽刺猬和沼泽豚草蓬勃发展。众多的蝴蝶品种侵入边缘、空地和树丛中：天青色的Sylvain、大变色的Mars、地图、Machaon、aurora、柠檬等。两栖动物包括敏捷蛙、绿蛙和红蛙、冠状蛙、高山蛙和斑点蛙。
罗尔肖伦岛自然保护区的面积为309公顷，由157公顷的森林和25公顷的草地组成，其余部分由距离斯特拉斯堡仅10公里的河流区域组成。
埃尔斯坦森林自然保护区几乎全是森林。占地180公顷的场地被吉森河的前活跃臂膀的密集网络纵横交错。
德国的Rhinau岛和邻近的Taubergiessen保护区因其对保护在那里过冬的鸟类的极大兴趣而闻名。莱茵瑙岛自然保护区占地311公顷，是该岛南部三分之二的地区。它由Conservatoire des Sites Alsaciens管理，提供导游服务。
最后，第一个分类的小卡马格（Petite Camargue alsacienne），提供了莱茵河丛林的遗迹和见证。
